гічні двома варіантами гена 18S рРНК в геномі еукаріот, оскільки рибосомні гени прокаріотів не утворюють тандемних повторів.
Філогенетична цінність гена РНК малої рибосомной субодиниці полягає в тому, що він, з одного боку, має консервативні ділянки, що дозволяють провести вирівнювання послідовностей різних видів, навіть у разі низького ступеня їх спорідненості. З іншого боку, варіабельні ділянки гена є філогенетично інформативними і використовуються для визначення філогенетичних відносин між спорідненими видами (Hillis, Dixon, 1991) і таксонами високого рангу.
Проведене дослідження гена 18S рРНК у 10 видів північно-американських осетрових риб виявило, що у деяких з них спостерігається множинність алелей досліджуваного гена (Krieger, Fuerst, 2002). У результаті часткового секвенування 33 клонів гена малої субодиниці озерного осетра (A. fulvescens) було виявлено 17 варіантів послідовностей. Ці варіанти були повністю секвенувати і з 1783 сайтів 159 показали мінливість. У теж час, секвенування гена 18S рРНК веслоносов (Polyodon spathula) не виявило наявності генних варіантів. При порівнянні послідовностей виявлено, що лише один з клонів 18S РДНК озерного осетра є найбільш близьким до послідовності гена веслоносов, відрізняючись від нього всього однієї нуклеотидної заміною. Дослідники вважають, що множинні варіанти рибосомних генів з'явилися у осетрових після розбіжності сімейств Acipenseridae і Polyodontidae.
Існує кілька ймовірних причин наявності у осетрових риб множинності алелей гена 18S рРНК. Перша - це тканеспеціфічность генних варіантів. За даними Крігер з співавторами (Krieger et al., 2004) Af - 7 є основним варіантом, експрессіруемим в тканинах печінки. В інших тканинах в якості основних алелей можуть виступати інші варіанти. Для перевірки цієї гіпотези необхідно детальне дослідження експресії рРНК у всіх тканинах осетрових риб. Однак самим дослідникам цей варіант не здається прийнятним, тому що за наявності, як мінімум, 17 варіантів гена 18S рРНК, слід припустити наявність 17 типів тканин, що використовують ці варіанти. Малоймовірно, що такій кількості тканин необхідно стільки варіантів спеціально адаптованих рибосом. Хоча можливість того, що кілька варіантів все ж можуть бути тканеспеціфічнимі повністю виключити не можна. Тоді навіщо потрібні інші аллели? Якщо допустити, що всі 17 варіантів дійсно тканеспеціфічни, то ймовірність того, що клон Af - 7 експресується тільки в печінці дорівнює 1 до 17, або близько 6% (Krieger, 2002).
Другою можливою причиною даного феномена може бути специфічність деяких, а можливо і всіх, варіантів до стадій розвитку організму. Наприклад, у малярійного плазмодія існує два типи рРНК, оскільки його цикл розвитку проходить через дві стадії (Dame et al., 1984; Gunderson et al., 1987; Waters et al., 1989; Quari et al., 1994; Rogers et al ., 1995). Оскільки осетрові риби не мають подібних стадій розвитку, то необхідність кількох варіантів 18S рРНК можна допустити лише для анадромних видів. Але ареал озерного осетра, у якого вперше і був виявлений цей феномен, обмежений прісними водами Великих і деяких інших озер півдня Канади. Очевидно, що дана гіпотеза також не підходить для пояснення множинності алелей гена 18S рРНК. Основним чинником, що сприяє походженням і підтримці множинності копій гена 18S рРНК, на думку більшості авторів, вважається поліплоїдну природа генома осетрових риб...
