ерівника слідчого органу є найбільш повною та оптимальної, однак, на нашу думку, цю класифікацію слід доповнити розмежуванням функцій відповідно до їх статусом. Так, ми пропонуємо додатково диференціювати функції керівника слідчого органу на три групи:
основні;
додаткові;
факультативні.
Основна функція керівника слідчого органу полягає в контролі над виробництвом попереднього розслідування, процесуальному керівництві. Даною точки зору дотримується більшість сучасних процесуалістів, у тому числі З.Р. Агаєв, А.Г. Халіулін, Н.В. Буланова та інші.
Додаткові функції керівника слідчого органу покликані забезпечити виконання основної його функції, зокрема це повноваження з контролю над виробництвом слідчими попереднього слідства.
Факультативні функції за своєю природою є необов'язковими для виконання, і своєю метою мають забезпечення реалізації основної та додаткових функцій при наявності такої необхідності. До таких функцій зокрема можна віднести організацію роботи слідчого органу.
На думку деяких процесуалістів функції керівника слідчого органу тотожні його повноважень. Дана точка зору представляється нам помилковою у зв'язку з тим, що функція являє собою вид діяльності, і є більш широким поняттям, ніж повноваження.
На наш погляд цікавою видається класифікацій функцій керівника слідчого органу, запропонована Моругіной Н.А. На її думку, слід виділяти такі функції:
обвинувачення;
процесуального керівництва;
- контролю над виробництвом попереднього слідства;
- кримінального переслідування.
Слід зазначити, що в даний час керівник слідчого органу, як учасник кримінального процесу крім процесуального контролю і керівництва діяльністю слідчих на попередньому слідстві, також реалізує й організаційні функції. Як зазначає у своїй роботі Т.Ю. Попова, контрольні та керівні повноваження розширилися, зокрема, за рахунок передачі (або дублювання) керівнику слідчого органу частини прерогатив прокурора (наприклад, щодо скасування рішень слідчого, поверненню справи для додаткового розслідування і т.д.). У цьому зв'язку неможливо не вказати на нові для досліджуваного суб'єкта напрямки службової діяльності, такі як реалізація дозвільних повноважень. До таких повноважень автори в науковій літературі відносять: виробництво слідчих дій і обрання запобіжних заходів, що обмежують конституційні права громадян; на оскарження рішень прокурора) та здійснення прерогатив з нагляду за попереднім слідством (зокрема, використання права вирішувати скарги на дії слідчого). При всьому цьому законодавець залишив за керівником слідчого органу право самостійно здійснювати кримінальне переслідування та організацію роботи слідчого підрозділу. Дана функція є важливою для провадження попереднього слідства.
Важливою функцією керівника слідчого органу є функція керівництва процесуальною діяльністю, здійснюваної слідчим. Ця функція прямо не закріплена законодавцем, проте має місце бути в практичній діяльності органів попереднього розслідування. На думку І.А. Насонової, зміст даної функції полягає в направленні керівником слідчого органу діяльності слідчого, пов'язаної з порушенням і розслідуванням кримінальних справ. Важко переоцінити важливість цієї функції, оскільки, керівник слідчого органу при її виконанні, забезпечує законність провадження слідчих дій, з метою дотримання вимог про допустимість отриманих доказів. Однак, не всі автори в науковій літературі вважають такий напрямок діяльності функцією. Так, на думку І.В. Ємельянової, це не функція, а «процесуальний принцип керівництва розслідуванням». На нашу думку, дане припущення є помилковим, оскільки з нього випливає, що дана діяльність здійснюється тільки на стадії розслідування кримінальної справи, що суперечить КПК РФ, який встановлює, що керівник слідчого органу здійснює керівництво процесуальною діяльністю слідчого і до порушення кримінальної справи. Зміст даної функції докладно розкривається в науковій літературі. Так, на думку А.М. Ларіна, процесуальне керівництво слідством являє собою самостійну функцію, зміст якої полягає у прийнятті рішень про спрямування слідства і провадження слідчих дій, дачі вказівок і доручень, пред'явленні вимог, виконання яких є обов'язковим. До даної функції відноситься повноваження слідчого по дачі обов'язкових вказівок слідчим, що представляє основну тему нашого дослідження. Більш докладно дана функція буде розглянута в наступному розділі.
Слід зазначити, що перелік повноважень, зазначений в статті 39 КПК України є неповним. Керівник слідчого органу наділений правами і обов'язками посадової особи, зазначеними в різних інструкціях Слідчого комітету РФ, МВС ...