За інспекторської, стройової і господарської частини він входив в систему Військового міністерства. По «спостережної частини», організації та ведення політичного розшуку, дізнань підпорядковувався III Відділенню.
Указами від 3 і 4 березня 1880 керівництво всіма цими установами перейшло в руки Лоріс-Мелікова. Одночасно йому були представлені всі права і «коло дій», присвоєні законом шефу жандармів.
11 квітня 1880 Лоріс-Меліков передав Олександру II всеподданнейший доповідь (Додаток 3), який був програмою подальших заходів ВРК для вирішення поставлених перед нею завдань. У першій частині доповідної записки говорилося про те, що встигла зробити Комісія (координація діяльності жандармських органів і поліції, прискорення процесів розгляду дізнань у політичних справах, врегулювання питання адміністративної посилання і т.д.). Далі в доповіді зазначалося, що для виведення країни з кризи необхідно провести реформи, що стосуються різних сторін суспільного життя Росії. У частині, що стосується «охорони державного порядку та громадського спокою», пропонована програма складалася з п'яти пунктів.
Примітно, що ця частина доповіді була найбільш уважно прочитана Олександром II, деякі абзаци були відзначені олівцем з позначкою «так». У першому пункті Лоріс-Меліков пропонував «йти твердо і рішуче в справі переслідування зловмисників, але не змішувати з ними людей, винних лише в проступках, що не мають прямого відношення до соціально-революційних проявів».
У другому пункті зазначалося: «Всіляко прагнути до встановлення повної єдності дії всіх органів урядової влади, покликаних до боротьби із злочинними псевдовченнями, до об'єднання, зосередження і посиленню діяльності різного роду поліцій (міський, повітової, жандармської і розшукової) ... »[2; с. 432]
У третьому пункті Лоріс-Меліков особливо підкреслював, що необхідно «прагнути до повернення від надзвичайних заходів до законного течією справи».
Два останні пункти містили перелік пропонувалися конкретних заходів щодо нормалізації суспільних відносин, підкреслювалася необхідність «спонукати урядові установи та особи до більш уважного ставлення до виразився нагальним потребам населення і його представникам». Говорилося також про перегляд паспортної системи полегшенні селянських переселень, перетворенні губернських адміністративних установ, встановленні відносин наймачів до робітників і т.д.
Хоча пропозиції Лоріс-Мелікова, на перший погляд, мали обмежений характер, але вже сама постановка питання про те, що в даний період не можна обмежуватися тільки каральними і поліцейськими заходами, а необхідно проводити певні перетворення, вказувала на серйозність, намірів голови Комісії.
В кінці доповіді Лоріс-Меліков зазначав, що розробка пропонованих заходів «становитиме предмет дбайливості підлягають міністрів та інших вищих установлений», але «збудження питань», окреслених в програмі і. обговорення «своєчасності запропонованих з цією метою заходів повинно входити в коло діяльності Верховної розпорядчої Комісії».
Доповідь припускав ще більш широке поле діяльності ВРК. Він був схвалений Олександром II, який наклав вельми примітну резолюцію:
«Дякую за відверте виклад твоїх думок, які майже у всьому згодні з моїми власними. Бачу із задоволенням, що ...
