Система заходів повинна бути спрямована на досягнення програмних цілей і узгоджена за ресурсами, виконавцями та строками. Для підвищення ефективності програм дуже важлива послідовність, Постадійний і комплексність намічуваних робіт. Для дотримання принципів системності, послідовності та збалансованості намічуваних заходів можна використовувати конструкції енерговиробничих і відтворювальних циклів. У першому випадку чітко простежується економіко-технологічний ланцюжок виробництв від видобутку сировини і палива (енергії) аж до отримання готової продукції та споживання. У другому випадку проглядається весь відтворювальний процес від наукової ідеї до створення нових і реконструкції існуючих виробництв. Сукупність заходів з технологічного та воспроизводственному ознаками дозволить збалансувати не тільки регіональну економіку, але й всі сфери життєдіяльності людей.
При розробці програм особливо ретельно потрібно розрахувати і збалансувати ресурсне забезпечення. У структурі забезпечення виділяються фінансові, інформаційні, інноваційні, конституційні та інші ресурси. Фінансові витрати складаються з витрат на розробку програм і витрат на її реалізацію. Вартість наукових досліджень і розробок включає не тільки поточні витрати, а й витрати на оплату праці, утримання органів, що регулюють процес реалізації програм, транспортних послуг та зв'язку, відряджень і т. Д.
Фінансове забезпечення регіональних програм здійснюється за рахунок бюджетних і позабюджетних коштів. У першу чергу, звичайно, орієнтуються на власні бюджети суб'єктів Федерації, а також на федеральний бюджет і бюджети зацікавлених муніципальних утворень. Позабюджетні джерела включають власні кошти підприємств та фондів, кредити банків, приватних інвесторів та ін. У зв'язку з обмеженням фінансового забезпечення дуже важливим моментом є відбір пріоритетних проектів і програм, енерговиробничих ланцюжків виробництв.
Інструмент реалізації цільових програм включає всі важелі регіональної політики. По відношенню до об'єктів регіональної власності це може бути пряме фінансування і численні прояви кредитно-грошового механізму, а також пільги по податках, експортно-імпортних мит. По відношенню до об'єктів інших форм власності діють непрямими економічними методами (пільгові кредити, податкові послаблення та ін.).
Відкриття фінансування реалізації цільових програм має бути узгодженим з іншими видами ресурсного забезпечення. Кожен запланований об'єкт, вдало «вписуючи» в регіональну структуру, слід «забезпечити» раціональним місцем на території регіону і в геоекологічне просторі, природними і трудовими ресурсами, інфраструктурним обслуговуванням.
