вили протест відмови мусульманам у праві на проведення зборів і з'їздів. У серпня 1906 на III з'їзді була вироблена програма, близька за змістом до ідей кадетської партії. У ній виразилися вимоги про рівність всіх російських громадян незалежно від статі, віросповідання, раси та національності.
Безсумнівно, після 1905 невирішені проблеми краю стали лише посилюватися, а релігійний фактор міцніти: крім традиційних кіл в особі духовенства, підключилися і вищезгадані джадіди, а також діячі з, наприклад, Туреччини. Якщо раніше, багатьох влаштовував такий стан справ, то тепер невтручання створювало ситуацію стримування розвитку.
Сама ж політика влади в краї стала тепер більш «залежна» від релігійного чинника; доводилося все частіше озиратися на мусульманське світогляд культуру як на обов'язкову і складову частину життя жителів Туркестану. Тепер влада не вважали, що іслам «відімре сам собою». Однак вироблення нового курсу значно затягнулася. Можливо, пов'язано це з відомою чехардою генерал-губернаторів краю на початку XX ст., А також з тим, що у влади було достатньо проблем і в інших регіонах. Таке зволікання викликало зниження авторитету влади. Все частіше стали відбуватися випадки непокори (на побутовому та адміністративному рівні) місцевих жителів влади.
Нерозуміння між владою і жителями, незважаючи на усвідомлення необхідності змін, залишалося, як і раніше. Практично всі генерал-губернатори, які змінили С. М. Духівського не вважали за можливе починати серйозні перетворення саме в цей момент. Але, як вже, було сказано, сам релігійний фактор постійно фігурує в різних доповідях і циркулярах.
На думку багатьох дослідників, що затяглася Перша світова війна принесла Росії мало перемог і значно більше поразок, вона виснажила її не дуже сильну економіку і обмежені фінансові ресурси. До 1916 р військові тяготи відчувалися повсюдно, в тому числі і в Туркестанському генерал-губернаторстві. Було зрозуміло, що незабаром має наступити переломний момент, правда не було ясно, на чию користь.
У 1916 р в центрально-азіатських володіннях Росії почалося повстання, причиною якого послужив указ про примусове залучення на тилові роботи в прифронтових районах чоловічого інородческого населення у віці від 19 до 43 років включно. Повстання почалося 4 липня 1916 в Ходженте, розташованому в Самаркандської області. Антиурядові виступи швидко охопили величезну територію - від Амудар'ї до Уралу з багатонаціональним, переважно мусульманським населенням приблизно в 10 млн. Чоловік. Вже в липні 1916 відбулося 25 виступів у Самаркандської області, 20 і 86 в Сирдар'їнською і Ферганської областях відповідно. Форми їх були різні - від масового відходу з підприємств і втечі в степи, гори і за кордон до збройних нападів на чиновників, війська і поліцію. Під час повстання активізувалися місцеві духовні лідери (ішани), що сприяло доданню повстанню релігійного відтінку в умах населення. Такий розвиток подій цілком природно для цього регіону, де традиційні сили ісламу ніколи не слабшали. Духовенство в будь-який момент було готове звинуватити російські власті в тому чи іншому гріху проти мусульман та ісламу, надавши повстанню релігійний відтінок. Однак, справедливості заради, варто сказати, що деякі з них були прихильниками офіційної влади.
Наприкінці липня 1916 генерал-губернатором Туркестанського краю призначили Олексія Миколайовича Куропаткина, на якого покладали великі надії як на знавця Азії. До початку нового 1917 повстання було придушене майже повсюдно, що дозволило А.Н. Куропаткину проаналізувати причини даного повстання. Імператору були відправлені два досить розлогих доповіді. Причини, на думку А.Н. Куропаткина, були наступні: 1) Непослідовна політика влади і її нетвердість в краї; 2) часта зміна особового складу вищої крайової влади, кадри який найчастіше були при цьому не знайомі зі специфікою регіону; 3) мале матеріальне забезпечення особового складу посадових осіб, які покликані управляти тубільним населенням; 4) посилене відчуження киргизьких земель під російські селища без дотримання в багатьох випадках інтересів населення. Бачиться, що Куропаткін вважав, що не указ імператора про мобілізацію населення на фронтові роботи став головне причиною, але лише послужив каталізатором, істинні ж причини, на його думку лежали набагато глибше і названі вище. Деякі дослідники, все ж підкреслюють, що даний указ зіграв свою важливу роль і сам по собі. Відомо, що умови указу були прийнятними. Проте, в цьому разі, не налагоджені відносини влади з мусульманським духовенством зіграли свою фатальну роль. Стали поширюватися чутки, що людей по шляху будуть хрестити, а додому повернути буде не можна і т. П. Такі чутки намагалися спростувати, наприклад, особи духовного звання, у яких були тісні взаємини з російською владою. Очевидно, що ця проблема не була б настільки гострою...
