адзу Такахіса, він вже тоді просив у дайме дозволу поїхати в Кіото, але в той раз Сімадзу свого дозволу не дав, мотивуючи відмову тим, що протягом наступних декількох місяців вітер посилиться і погода буде несприятливою для тривалої подорожі. Однак після того, як дайме видав декрет, що забороняє перехід в християнство, він не тільки дозволив єзуїтам покинути Кагосіма, а й спорядив корабель для поїздки в Хірадо. Главою християнської громади в Кагосіма Ксавьє призначив самурая Андзіро, залишивши йому зображення Діви Марії, копії «Доктрини Христа» і «Символ Віри», церковний статут і докладні інструкції щодо управління католицькою громадою. Пробувши в Кагосіма більше року, Франциск Ксав'є наприкінці серпня 1550 залишив свою паству і разом з батьком Торресом, Бернардом, виїхав до Хірадо.
В Хірадо португальці влаштували на честь прибулих місіонерів гарматний залп, а дайме Хірадо, мацурі Таканобу надав єзуїтам дуже теплий прийом, сподіваючись таким чином зміцнити відносини з португальськими торговцями. У такій сприятливій обстановці Франциск Ксав'є негайно приступив до публічної проповіді, зачитуючи, як і раніше, переведений катехізис і «Символ Віри»; йому допомагав брат Фернандес, який до того моменту вже навчився швидко розмовляти японською мовою і відкрито проповідувати серед великого скупчення народу. Незабаром чисельність хрещених японців перевищила 100 осіб, серед яких був японець по імені Кімура, його син, Себастьян Кімура, згодом став першим японським католицьким священиком, який прийняв мученицьку смерть.
Вирішивши залишити батька Торреса й інших у Хірадо, Ксавьє разом з братом Фернандесом і Бернардом відправляються в кінці жовтня в Кіото. По дорозі вони зупиняються в Ямагуті, який на той момент був політичним і культурним центром західного Хонсю. По прибуттю в Ямагучі єзуїти відразу приступили до читання проповідей, в яких вони різко засуджували гріхи, пов'язані з гомосексуалізмом, ідолопоклонством або вбивством дітей (під цим насамперед малися на увазі аборти). У своєму листі до Португалії Франциск Ксав'є пояснює, що саме ці три гріха широко поширені серед японців. Вже через кілька днів про Ксавье і його супутниках говорило все місто, були й ті, хто з великим інтересом слухав місіонерів, але були й такі, хто не соромився відкрито сміятися і знущатися над єзуїтами. Не оминув своєю увагою іноземних місіонерів і дайме Ямагуті, Оути Еситака, запросивши їх на аудієнцію в свій замок. При зустрічі Еситака задавав різні питання Ксавьє про його походження і цілі візиту до Японії, уважно слухав брата Фернанда, який більше години читав проповідь перед дайме, проте як тільки мова зайшла про содомських гріхах і засудженні гомосексуалізму, особа Оути потемніло, і, ледве стримуючи гнів , він жестом дав зрозуміти, що аудієнція закінчена.
Незабаром Ф. Ксав'є покидає Ямагуті, упевнившись, що серед жителів цього міста дуже мало бажаючих прийняти хрещення і стати справжніми християнами, і, проробивши довгий подорож, в якому йому і його компаньйонам довелося пережити багато чого, починаючи з моторошного холоду і закінчуючи небезпекою бути схопленим піратами, нарешті прибуває до столиці Японії того часу - Кіото. Однак тут його чекало величезне розчарування. У аудієнції з імператором він отримав категоричну відмову через жебрака зовнішнього вигляду, так само і буддійські ченці школи Тендай з монастиря Енрякудзі, розташованого на горі Хией, який Ксавьє збирався ...
