lign="justify"> Ферменти є високоспецифічний каталізаторами. Вони виявляють специфічність відносно типу каталізуються хімічної реакції, причому утворення побічних продуктів не відбувається. Крім того, вони володіють вираженою субстратной специфічністю і, як правило, високою стереоспеціфічность.
1. Типи ферментів
Класифікація ферментів. Раніше при найменуванні ферментів за основу брали назву субстрату з додаванням суфікса «аза»; так з'явилися, зокрема, протеїнази, ліпази, карбогідрази. За вихідного принципом позначали ферменти, що каталізують окислювальні реакції (дегідрогенази). Деякі ферменти отримали спеціальні назви - трипсин, пепсин та ін. В даний час прийнята класифікація, в якій ферменти згруповані в 6 класів відповідно до типу каталізуються реакцій:
. Оксидоредуктази (окислювально-відновні реакції).
. Трансферази (реакції перенесення функціональних груп).
. Гідролази (реакції гідролізу).
. Ліази (реакції відщеплення груп негидролитическим шляхом).
. Ізомерази (реакції ізомеризації).
. Лігази (реакції синтезу за рахунок енергії АТР).
У межах класів ферменти групуються в підкласи і підкласи відповідно до особливостей каталізуються реакцій; на цій основі складена кодова нумерація (шифри) ферментів та їх систематичні назви. Шифр ферменту складається з чотирьох розділених крапками чисел: перше число означає клас ферменту, друге і третє числа - підклас та подподкласса відповідно, а четверте число - порядковий номер ферменту в його подподкласса. Наприклад, кисла фосфатаза має шифр 3.1.3.2; це означає, що вона відноситься до класу гідролаз (3.1.3.2), підкласу цих ферментів, що діють на складноефірні зв'язку (3.1.3.2), до подподкласса ферментів, гидролизующих моноефіри фосфорної кислоти (3.1.3.2), а порядковий номер ферменту в даному подподкласса- 2 (3.1.3.2).
Ферменти, що каталізують одну і ту ж реакцію, але виділені з різних видів живих організмів, різняться між собою. У номенклатурі ж вони мають загальну назву і один кодовий номер. Різні форми того чи іншого ферменту нерідко зустрічаються і в одного біологічного виду. Для найменування групи ферментів, що каталізують одну і ту ж реакцію і знаходяться в організмах одного виду, рекомендується термін множинні форми ферменту. Для тих ферментів однієї групи, які мають генетично обумовлені відмінності в первинній структурі, використовують термін «ізоферменти».
Оксідоредукта? зи - окремий клас ферментів, що каталізують лежать в основі біологічного окислення реакції, що супроводжуються переносом електронів з однієї молекули (відновника - акцептора протонів або донора електронів) на іншу (окислювач - донора протонів або акцептора електронів).
Реакції, що каталізуються оксидоредуктаз, в загальному вигляді виглядають так:
? + B? A + B?
Де A - відновник (донор електронів), а B - окислювач (акцептор електронів)
У біохімічних перетвореннях окислювально-відновні реакції іноді виглядають складніше. Ось, наприклад, одна з реакцій гліколізу:
н + глицеральдегид - 3-фосфат + НАД +? НАД · H + H + + 1,3-дифосфоглицерата
Тут як окислювач виступає НАД +, а глицеральдегид - 3-фосфат є відновником.
Систематичні назви ферментів класу утворюються за схемою «донор: акцептор + оксидоредуктаза». Однак широко використовуються й інші схеми іменування. Коли можливо, ферменти називають у вигляді «донор + дегидрогеназа», наприклад глицеральдегид - 3-фосфатдегидрогеназа, для другої реакції вище. Іноді назва записується як «акцептор + редуктаза», наприклад НАД + -редуктазою. В окремому випадку, коли окислювачем є кисень, назва може бути у вигляді «донор + оксидаза».
Згідно з міжнародною класифікацією і номенклатурою ферментів оксидоредуктаз відносяться до 1 класу, в межах якого виділяють двадцять другій підкласу:
КФ 1.1 включає ферменти, що взаємодіють з CH-OH групою донорів;
КФ 1.2 включає ферменти, що взаємодіють з альдегідної або оксо-групою донорів;
КФ 1.3 включає ферменти, що взаємодіють з CH-CH групою донорів;
КФ 1.4 включає ферменти, що взаємодіють з CH-NH 2 групою донорів;
КФ 1.5 включає ферменти, що взаємодіють з CH-NH групою донорів;
КФ 1.6 включає ферменти, що взаємодіють з НАД · H або НАДФ · H;
КФ 1.7 включає ферменти, що взаємодіють з іншими азотовмісними сполуками як донорів;
КФ 1.8 включає ферменти, що взаємодіють з сероусоде...
