ець-азотна зв'язок
КФ 3.6 кислотний ангідрідкіслотний ангідрид-гідролаза (ХЕЛІКАЗИ, ГТФаза)
КФ 3.7 вуглець-вуглецевий зв'язок (CC)
КФ 3.8 галогенна зв'язок
КФ 3.9 азотно-фосфорна зв'язок (PN)
КФ 3.10 азотно-сірчана зв'язок (SN)
КФ 3.11 вуглецево-фосфорна зв'язок (CP)
КФ 3.12 дисульфідний зв'язок (SS)
КФ 3.13 сіро-вуглецевий зв'язок (CS)
Ліа? зи (синтази) - окремий клас ферментів, що каталізують реакції негидролитическим і неокислювального розриву різних хімічних зв'язків (CC, CO, CN, CS та інших) субстрату, оборотні реакції освіти і розриву подвійних зв'язків, що супроводжуються відщепленням або приєднанням груп атомів по її місцю, а також утворенням циклічних структур.
У загальному вигляді назви ферментів утворюються за схемою «субстрат + ЛіАЗ». Проте частіше у назві враховують підклас ферменту. Ліази відрізняються від інших ферментів тим, що в каталізуються реакціях в одному напрямку беруть участь два субстрату, а в зворотної реакції тільки один. У назві ферменту присутні слова декарбоксилаза і альдолаза або ЛіАЗ (піруват-декарбоксилаза, оксалат-декарбоксилаза, оксалоацетат-декарбоксилаза, треонін-альдолаза, фенілсерін-альдолаза, ізоцитрат-ЛіАЗ, аланін-ЛіАЗ, АТФ-цитрат-ЛіАЗ та ін.), а для ферментів, що каталізують реакції відщеплення води від субстрату - дегідратази (карбонат-дегідратази, цитрат-дегідратази, серин-дегідратази та ін.). У тих випадках, коли виявлена ??тільки зворотна реакція, або цей напрямок в реакціях більш істотно, в назві ферментів присутністю слово синтаза (малат-синтаза, 2-ізопропілмалат-синтаза, цитрат-синтаза, гідроксіметілглутаріл-CoA-синтаза та ін.).
Приклади: гістідіндекарбоксілаза, фумаратгідратаза.
За міжнародною класифікацією і номенклатурою ферментів ліази належать до 4 класу, в межах якого виокремлюють сім підкласів:
КФ 4.1 включає ферменти, які розщеплюють вуглець-вуглецеві зв'язки, наприклад, д?? карбоксілази (карбокси-ліази);
КФ 4.2 - ферменти, що розщеплюють вуглець-кисневі зв'язку, наприклад, дегідратази;
КФ 4.3 - ферменти, що розщеплюють вуглець-азотні зв'язку (амідін-ліази);
КФ 4.4 - ферменти, що розщеплюють вуглець-сірчані зв'язку;
КФ 4.5 - включає ферменти, що розщеплюють зв'язку вуглець - галоген, наприклад, ДДТ-дегідрохлоріназа;
КФ 4.6 - ферменти, що розщеплюють фосфор-кисневі зв'язку, наприклад, аденилатциклаза;
КФ 4.99 - включає інші ліази
Ізомерази - ферменти, що каталізують структурні перетворення ізомерів (рацемізації або епімерізація). Ізомерази каталізують реакції, подібні наступній :? B, де B є ізомером A.
У назві ферменту присутнє слово рацемази (аланін-рацемази, метіонін-рацемази, гідроксипролін-рацемази, лактат-рацемази та ін.), епімерази (альдозами - 1-епімерази, рібулозофосфат - 4-епімерази, УДФ-глюкуронати - 4-епімерази та ін.), ІЗОМЕРАЗИ (рібозофосфат-ІЗОМЕРАЗИ, ксілозоізомераза, глюкозамінфосфат-ІЗОМЕРАЗИ, еноіл-СоА ІЗОМЕРАЗИ та ін.), мутази (фосфогліцерат-мутази, метіласпартат-мутази, фосфоглюкомутаза та ін.).
Ізомерази мають власну класифікацію, КФ 5 і мають наступні підкласи:
КФ 5.1 включає ферменти, що каталізують рацемізації (рацемази) і епімерізацію (епімерази)
КФ 5.2 включає ферменти, каталізірущіе геометричну изомеризацию (цис-транс ізомерази)
КФ 5.3 включає внутрімолекулярні оксидоредуктаз
КФ 5.4 включає трансферази (мутази)
КФ 5.5 включає внутрімолекулярні ліази
КФ 5.99 включає інші ізомерази, в тому числі, топоізомерази
Лігази (синтетази). До класу лігаз відносять ферменти, що каталізують синтез органічних речовин з двох вихідних молекул з використанням енергії розпаду АТФ (або іншого нуклеозидтрифосфат). Систематичне назва їх складають за формою «X: Y лігаза», де X і Y позначають вихідні речовини. Як приклад можна назвати L-глутамат: аміак лігази (рекомендований скорочена назва «глутамінсінтета-за»), за участю якої з глутамінової кислоти та аміаку в присутності АТФ синтезується глутамін.
Лігази підрозділяють за типом зв'язку, утворення якої вони каталізують: O-лігазаS-лігазаN-лігазаC-лігаза
. Структура ферментів
У природі існують як прості, так і складні ферменти. Перші цілком представлені поліпептидними ланцюгами і при гідролізі розпадаються виключно на амінокислоти...