важливе значення з них мають карбоксилаза, альдегідліаза (альдолаза) та ін
Ізомерази - ферменти, що прискорюють переміщення усередині молекул водню, фосфору і подвійних зв'язків, що має важливе значення в обміні речовин. До цієї групи відносяться фосфогексоізомераза, тріозофосфотізомераза та ін
Лігази або синтетази - ферменти, що прискорюють синтез складних з'єднань з простіших за рахунок розпаду пірофосфорна зв'язків (в АТФ або інших багатих енергією пірофосфатів). Лігази відіграють велику роль у синтезі білків, нуклеїнових кислот, жирних кислот та інших сполук. У цей клас входить близько 100 ферментів. Представники цієї групи - аспарагінсінтетаза, глютаміпсінтетаза та ін
