ється основним джерелом нових генів в еволюції. Дубльовані гени можуть розходитися і здобувати нові функції, або вони можуть стати функціонально інактивованими і залишатися в геномі як псевдогени. Третім варіантом може бути збереження їх у первісному вигляді; останнім варіантом гомогенізації цих послідовностей виступає узгоджена еволюція, щоб уповільнити генетичне і функціональна різноманітність. Очевидно, що поява генетичного різноманіття показує, що процес гомогенізації не є універсальним. Тепер ясно, що не всі повторювані сімейства піддаються узгодженої еволюції, як обговорювалося вище (Nei et al., 1997).
Узгоджена еволюція - це фундаментальний процес, що відбувається у всіх організмах. Вивчення мультігенних родин, таких як рДНК і мяРНК в різних популяціях є необхідним для отримання корисної інформації про динаміку мультігенних з популяцій, що дасть ключ до розгадки механізму узгодженої еволюції (D. Liao, 1999).
1.2 Коротка характеристика використовуваних методів і маркерів
1.2.1 Полімеразна ланцюгова реакція
Полімеразна ланцюгова реакція - це метод, що імітує природну реплікацію ДНК і дозволяє виявити єдину специфічну молекулу ДНК в присутності мільйонів інших молекул. Відкриття методу полімеразної ланцюгової реакції (PCR) стало одним з найбільш видатних подій в галузі молекулярної біології за останні десятиліття, що дозволило підняти молекулярну біологію на якісно новий рівень.
Вперше складу реакційної суміші для постановки полімеразної ланцюгової реакції, і принципи використання праймерів (коротких штучно синтезованих ланцюжків ДНК) для одержання копій ДНК були описані в 1971 році. Однак тоді ще не була продемонстрована основна риса PCR - експоненціальне збільшення кількості копій фрагмента вихідної ДНК як результат реакції.
У 1983 році Керрі Мюлліса (Mullis, 1983) був запропонований метод, який став надалі відомим як полімеразна ланцюгова реакція. Суть методу полягає в багаторазовому копіюванні (ампліфікації) в пробірці певних ділянок ДНК в процесі повторюваних температурних циклів. На кожному циклі ампліфікації синтезовані раніше фрагменти знову копіюються ДНК-полімеразою. Завдяки цьому відбувається багаторазове збільшення кількості специфічних фрагментів ДНК в мільярди разів, що значно спрощує подальший аналіз.
Полімеразна ланцюгова реакція - метод ампліфікації ДНК in vitro, за допомогою якого, протягом декількох годин, можна виділити і розмножити певну послідовність ДНК в мільярди разів. Можливість отримання величезної кількості копій одного строго певної ділянки геному значно спрощує дослідження наявного зразка ДНК.
Для проведення полімеразної ланцюгової реакції необхідне дотримання ряду умов:
Наявність в реакційній суміші таких компонентів:
1 Праймери - штучно синтезовані олігонуклеотиди, що мають, як правило, розмір від 15 до 30 п.н., ідентичні відповідним ділянках ДНК-мішені. Вони грають ключову роль в утворенні продуктів реакції ампліфікації;
2 Taq-полімераза - термостабільний фермент, що забезпечує добудовування 3-кінця дочірньої ланцюга ДНК згідно з принципом комплементарності;
Суміш дезоксинуклеотидтрифосфатов (дНТФ), (дАТФ), (ДГТФ), (дЦТФ) і (дТТФ) - «будівельний матеріал», використо...
