шині обов'язково потрібно їх присутність.
Рис. 2. Денатурація і ренатівація рибонуклеази. А - нативна молекула рибонуклеази, в третинної структурі якої є 4 дисульфідні зв'язки; Б - денатурована молекула рибонуклеази; В - нативна молекула рибонуклеази, в структурі якої знов утворені 4 дисульфідні зв'язки між тими ж залишками цистеїну.
фолдін білок Паркінсон хвороба
Механізм згортання білків до кінця не вивчений. Експериментальне визначення тривимірної структури білка часто дуже складно і дорого. Однак амінокислотна послідовність білка зазвичай відома. Тому вчені намагаються використовувати різні біофізичні lt; https: //ru.wikipedia/wiki/%D0%91%D0%B8%D0%BE%D1%84%D0%B8%D0%B7%D0%B8%D0 % BA% D0% B0 gt; методи, щоб передбачити просторову структуру білка lt;http://ru.wikipedia/wiki/%D0%9F%D1%80%D0%B5%D0%B4%D1%81%D0%BA%D0%B0%D0%B7%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D1%81%D1%82%D1%80%D1%83%D0%BA%D1%82%D1%83%D1%80%D1%8B_%D0%B1%D0%B5%D0%BB%D0%BA%D0%B0gt; з його амінокислотної послідовності.
1) Структура і функціональна роль шаперонов в фолдінг білків
У процесі синтезу поліпептидних ланцюгів, транспорту їх через мембрани, при складанні олігомерних білків виникають проміжні нестабільні конформації, схильні до агрегації. На знову синтезованому поліпептиді є безліч гідрофобних радикалів, які в тривимірній структурі заховані усередині молекули. Тому на час формування нативної конформації реакційно-здатні амінокислотні залишки одних білків повинні бути відокремлені від таких же груп інших білків.
У всіх відомих організмах від прокариотов до вищих еукаріотів виявлені білки, здатні зв'язуватися з білками, що знаходяться в нестійкому, схильному до агрегації стані. Вони здатні стабілізувати їх конформацію, забезпечуючи фолдінг білків. Ці білки отримали назву шаперони .
. Класифікації шаперонов (Ш)
У відповідно до молекулярної маси все шаперони можна розділити на 6 основних груп:
· високомолекулярні, з молекулярною масою від 100 до 110 кД;
· Ш - 90 - з молекулярною масою від 83 до 90 кД;
· Ш - 70 - з молекулярною масою від 66 до 78 кД;
· Ш - 60;
· Ш - 40;
· низькомолекулярні шаперони з молекулярною масою від 15 до 30 кД.
Серед шаперонов розрізняють: конститутивні білки (високий базальний синтез яких не залежить від стресових впливів на клітини організму), і індуцібельная, синтез яких в нормальних умовах йде слабо, але при стресових впливах на клітину різко збільшується. Індуцібельная шаперони відносять до білкам теплового шоку raquo ;, швидкий синтез яких відзначають практично у всіх клітинах, які піддаються будь-яким стресовим впливам. Назва білки теплового шоку виникло в результаті того, що вперше ці білки були виявлені в клітинах, які піддавалися впливу високої температури.
. Роль шаперонов в фолдінг білків
При синтезі білків N-кінцева область поліпептиду синтезується раніше, ніж С-кінцева область. Для формування конформації білка потрібна його повна амінокислотна послідовність. Тому в період синтезу білка на рибосомі захист реакційно-здатних радикалів (особливо гідрофобних) здійснюють Ш - 70.
Ш - 70 - висококонсерватівний клас білків, який присутній у всіх відділах клітини: цитоплазмі, ядрі, ЕР, мітохондріях. В області карбоксильного кінця єдиною поліпептидного ланцюга шаперонов є ділянка, утворений радикалами амінокислот у формі борозенки. Він здатний взаємодіяти з ділянками білкових молекул і розгорнутих поліпептидних ланцюгів довжиною в 7-9 амінокислот, збагачених гідрофобними радикалами. У синтезирующейся поліпептидного ланцюга такі ділянки зустрічають приблизно через кожні 16 амінокислот.
фолдінг багатьох високомолекулярних білків, що мають складну конформацію (наприклад, доменне будова), здійснюється в спеціальному просторі, сформованому Ш - 60. Ш - 60 функціонують у вигляді олігомернoго комплексу, що складається з 14 субодиниць (рис. 1-23). ??
Ш - 60 утворюють 2 кільця, кожне з яких складається з 7 субодиниць, з'єднаних один з одним. Субодиниця Ш - 60 складається з 3 доменів: апікального (верхівкового), проміжного і екваторіального. Верхівковий домен має ряд гідрофобних залишків, звернених в порожнину кільця, сформованого субодиницями. Екваторіальний домен має ділянку зв'язування з АТФ і володіє АТФ-азной активністю, тобто здатний гідролізувати АТФ до АДФ і Н3РО4.
Шапероновий комплекс має високу спорідненість до білків, на поверхні яких є елементи, характерні для несвёрнутих молекул (насамперед ділянки, збагачені гідрофобними радикалами). Потрапл...