дміну від кількох білків RPA в інших архей і еукаріотах, кожна субодиниця RPA в M.acetivorans - RPA1, RPA2 і RPA3 є 4, 2 і 2 OB-фрагментами відповідно, і можуть виступати в якості окремих одноланцюгових ДНК-зв'язуючих білків. Крім того, кожен з трьох білків RPA, а також їх комбінації, очевидно, стимулюють активність подовження праймера BI ДНК-полімерази М. acetivorans,
як було показано раніше в лабораторних умовах для бактеріальних SSB і еукаріотичних RPA.
Архітектура SSB і RPA припускає, що вони складаються з різних комбінацій OB-фрагментів. Бактеріальні та еукаріотичні організми містять один тип SSB або RPA відповідно. З іншого боку, організми архей мають різні RPA, що складаються з різних організацій ОВ-фрагментів. Гіпотезу, що гомологичная рекомбінація може відігравати важливу роль у створенні такого розмаїття OB-фрагментів в клітинах архей була запропонована на основі експериментів, що характеризують з'єднання RPA з різними OB-фрагментами.
9. ДНК-полімераза
ДНК-полімераза каталізує утворення фосфодіефірних зв'язку між терміналом 3'-ОН ПРАЙМАЗИ і? - фосфатом вхідного трифосфату для продовження короткого праймера, і, отже, основного гравця в процесі реплікації ДНК. На основі подібності їх амінокислотних послідовностей ДНК-полімерази були розділені на сім сімей: A, B, C, D, E, X і Y.
Фундаментальна здатність ДНК-полімерази синтезувати дезоксірібонуклеотідние ланцюга в цілому зберігається, але більш конкретні властивості, в тому числі процессівность, точний синтез і підкладка нуклеотидной селективності розрізняються залежно від сім'ї. Ферменти в межах однієї сім'ї мають в основному схожі властивості. E. coli має п'ять ДНК-полімерази, Pol I, Pol II і Pol III, які відносяться до родин A, В і С відповідно. Pol IV і Pol V класифікуються в родині Y, як ДНК-полімерази для трансповреждающего синтезу (TLS). У еукаріотів є реплікативні ДНК-полімерази, Pol?, Pol? і Pol?, що належать родині B, і трансповреждающіе ДНК-полімерази,?,? і?, що належать родині Y.
Найбільш цікаву особливістю, виявленою до моменту початку цієї галузі досліджень було те, що археї дійсно мають еукаріотичні Pol? - подібні (Сім'я B) ДНК-полімерази. Члени кренархеот мають як мінімум дві ДНК-полімерази сім'ї B. З іншого боку, існує тільки одне сімейство B ДНК-полімерази у евріархей. Замість цього геноми евріархей кодують ДНК-полімерази сім'ї D, пропоновані як Pol D, яка здається специфічною для цих архей, і ніколи не була знайдена в інших областях.
Гени сімейства Y-подібних ДНК-полімерази зберігаються в кількох, але не всіх, архейних геномах. Роль кожної ДНК-полімерази в клітці архей цих пір не відома, проте ДНК-полімерази отримують чіткий розподіл.
Перше сімейство D ДНК-полімерази було визначено з P. furiosus, шляхом скринінгу ДНК-полімеразної активності в клітинному екстракті. Відповідний ген був клонований, що продемонструвало, що ця нова ДНК-полімераза складається з двох білків, названих DP1 і DP2, і виведені амінокислотні послідовності цих білків не зберігаються в ДНК-полімерази їх сімей. Pol D в P. ...
