им правилом щодо місійної діяльності було «спочатку завоювати любов, а потім нести слово». Молодий місіонер прагнув в першу чергу опанувати японською мовою, так як без його знання місіонерська діяльність не представлялася можливою. У той період часу не було ні словників, ні підручників граматики, а вчителі мови було знайти дуже важко, тому що бажає вивчити японську мову все доводилося робити самостійно: «Приїхавши до Японії, я, наскільки вистачило сил, став вивчати тутешній мову. Багато витрачено часу і праці, поки встиг я придивитися до цього варварському мові, позитивно важко в світлі, так як він складається з двох: природного японського та китайського, перемішаних між собою, але аж ніяк не змішаних в один. Не дарма колись католицькі місіонери писали, що японська мова винайдений самим дияволом, з метою захистити Японію від християнських місіонерів ... Видно, довго ще вивчають японську мову доведеться вивчати його інстинктом, чрез читання книг і механічне привчання себе до тих чи інших оборотам розмовної і письмовій мові ».
У підсумку о. Микола зміг найняти кількох вчителів і, завдяки постійному читанню японської літератури і спілкуванню з японцями, до 1868 році, за вісім років вивчення, успішно освоїв японську мову і так званий «камбун» - письмовий варіант японізірованного давньокитайського мови, на якому написана більша частина давньої літератури Японії з історії, релігії, філософії. Таке глибоке вивчення мови дало йому можливість розмовляти з місцевими богословами і грунтовно познайомитися з догматами буддизму.
Однак необхідно відзначити, що до буддійських священнослужителям, як і до простих японцям, російська місіонер ставився з повагою і ніколи не дозволяв собі ображати їх релігійне почуття або ж звинувачувати в якихось гріхах, тому буддійське духівництво було налаштоване по відношенню до нього доброзичливо. Те, з якою повагою ставилися до о. Миколі буддійські священнослужителі наочно ілюструє наступний епізод: Микола Касаткін зайшов в буддійський храм, щоб послухати проповідників; храм був заповнений народом, що сиділи по-японськи, підібгавши ноги. Бонзи стали саджати свого гостя, але в храмі не виявилося жодного стільця. Недовго думаючи, головний священнослужитель підвів ієромонаха Миколая до жертовника, зняв з нього різні прикраси і ввічливо запропонував відвідувачу сісти, на превеликий подив, майже жаху розгубленого місіонера.
Першим учнем отця Миколая, який прийняв православ'я, був самурай Такума Савабе. Він приходив до сина російського консула в Хакодате для викладання фехтувального мистецтва. Звернувшись до християнства, Савабе через рік привів до о. Миколі своїх друзів - лікаря Сакаї Токур і лікаря Урано дайдзе. Микола не поспішав хрестити своїх перших учнів, боячись піддавати їх небезпеці, оскільки закон, який погрожував смертною карою за прийняття християнства, ще не був скасований. Однак це не заважало їм вести місіонерську роботу серед свого оточення, і до весни 1868 до 20 японців готові були прийняти православне хрещення. У цей час пішов урядовий указ, що підтверджував колишнє заборона японцям приймати християнську віру. Також стало відомим, що в Нагасакі почалося гоніння на християн-католиків. Щоб зберегти свою нечисленну паству, ієромонах Микола вирішив розіслати на час новонавернених християн в далекі області для продовження місіонерської діяльності.
Бачачи, що православ'я почало поширюв...